MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012943	GC	3	6	1994549	1994554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_012943	A	6	6	2005482	2005487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012943	CGC	2	6	2005492	2005497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_012943	GC	3	6	2005504	2005509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_012943	CGT	2	6	2005526	2005531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_012943	ACT	2	6	2005557	2005562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_012943	GGTTGA	2	12	2005583	2005594	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_012943	CAG	2	6	2005603	2005608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_012943	AC	3	6	2005609	2005614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_012943	GAA	2	6	2005616	2005621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_012943	CCA	2	6	2005629	2005634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_012943	GGA	2	6	2005636	2005641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_012943	GGGCG	2	10	2009097	2009106	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3514	NC_012943	GCC	2	6	2009157	2009162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_012943	TCC	2	6	2009192	2009197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_012943	CGCGG	2	10	2009512	2009521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3517	NC_012943	GA	3	6	2009550	2009555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012943	GC	3	6	2009586	2009591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_012943	ATTT	2	8	2009616	2009623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_012943	CCG	2	6	2009672	2009677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_012943	CAC	2	6	2009708	2009713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_012943	CCA	2	6	2010560	2010565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_012943	GCT	2	6	2010628	2010633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_012943	GGA	2	6	2010642	2010647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_012943	GTC	2	6	2011012	2011017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_012943	CGT	2	6	2011041	2011046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_012943	GGT	2	6	2011059	2011064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_012943	GCT	2	6	2012261	2012266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_012943	GTC	2	6	2012277	2012282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_012943	G	6	6	2012325	2012330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_012943	TGC	2	6	2012414	2012419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_012943	AAG	2	6	2013094	2013099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_012943	G	6	6	2013110	2013115	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_012943	TAG	2	6	2013136	2013141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_012943	ACCA	3	12	2013187	2013198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_012943	CGA	2	6	2013255	2013260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_012943	GAG	3	9	2013281	2013289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_012943	CGA	2	6	2013326	2013331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_012943	GC	3	6	2013342	2013347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_012943	GC	3	6	2016411	2016416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_012943	GCC	2	6	2018232	2018237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_012943	CGT	4	12	2018251	2018262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_012943	CGA	2	6	2019833	2019838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_012943	CGA	2	6	2021269	2021274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_012943	GGC	2	6	2021342	2021347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_012943	CCGAC	2	10	2021367	2021376	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3547	NC_012943	GTT	2	6	2021389	2021394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_012943	AGCC	2	8	2021400	2021407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_012943	CGCGG	2	10	2021411	2021420	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3550	NC_012943	CG	3	6	2021424	2021429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_012943	TCG	2	6	2021436	2021441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_012943	AGG	2	6	2021454	2021459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_012943	CAT	2	6	2021741	2021746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_012943	GC	3	6	2022604	2022609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_012943	GCT	2	6	2022612	2022617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_012943	CGGCG	2	10	2023904	2023913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3557	NC_012943	GGC	2	6	2026515	2026520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_012943	GGC	2	6	2026594	2026599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_012943	CA	3	6	2026622	2026627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_012943	TGC	2	6	2026653	2026658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_012943	TGC	2	6	2026682	2026687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_012943	CG	3	6	2026703	2026708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_012943	CGC	2	6	2026737	2026742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_012943	GGC	2	6	2026772	2026777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_012943	TCGT	2	8	2026801	2026808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_012943	CTT	2	6	2026820	2026825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_012943	GCC	2	6	2026836	2026841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_012943	CGT	2	6	2027919	2027924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_012943	CCG	2	6	2027925	2027930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_012943	CGA	2	6	2028852	2028857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_012943	CGT	2	6	2028871	2028876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_012943	GGC	2	6	2028881	2028886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_012943	TAG	2	6	2028892	2028897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_012943	TG	3	6	2028934	2028939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_012943	CCT	2	6	2034054	2034059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_012943	GCGCG	2	10	2034111	2034120	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3577	NC_012943	ACC	2	6	2034145	2034150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_012943	TGGC	2	8	2034157	2034164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_012943	GCA	2	6	2038580	2038585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_012943	CGG	3	9	2038593	2038601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_012943	CCG	2	6	2038602	2038607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_012943	CGC	2	6	2038615	2038620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_012943	CTC	2	6	2038664	2038669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_012943	GTT	2	6	2038722	2038727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_012943	CCG	2	6	2038788	2038793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_012943	CG	3	6	2038792	2038797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_012943	CCT	2	6	2042525	2042530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_012943	CGG	2	6	2042557	2042562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_012943	CTTG	2	8	2042565	2042572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_012943	GGTAG	2	10	2044472	2044481	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_012943	GCCG	2	8	2046432	2046439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_012943	GGC	2	6	2046504	2046509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_012943	CG	3	6	2046539	2046544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_012943	AAT	2	6	2046610	2046615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_012943	GGTC	2	8	2046681	2046688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_012943	AT	3	6	2046774	2046779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_012943	C	6	6	2046873	2046878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3598	NC_012943	TCC	2	6	2047992	2047997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_012943	GCT	2	6	2048072	2048077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_012943	CCG	2	6	2048103	2048108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_012943	ATC	2	6	2048532	2048537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_012943	TCAGA	2	10	2049453	2049462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3603	NC_012943	GGT	2	6	2049509	2049514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_012943	ATC	2	6	2049518	2049523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_012943	CA	3	6	2049554	2049559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_012943	TTCTAT	2	12	2049686	2049697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3607	NC_012943	ATC	2	6	2050203	2050208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_012943	TCAGA	2	10	2051124	2051133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3609	NC_012943	GT	3	6	2051164	2051169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_012943	AGT	2	6	2051198	2051203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_012943	GGC	2	6	2051277	2051282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_012943	CG	3	6	2051288	2051293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_012943	A	6	6	2051299	2051304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_012943	CTAG	2	8	2051315	2051322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_012943	ACG	2	6	2051352	2051357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_012943	AGT	2	6	2051398	2051403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_012943	CCG	2	6	2051405	2051410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_012943	TGG	2	6	2051425	2051430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_012943	GCCG	2	8	2051433	2051440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_012943	AGGC	2	8	2051446	2051453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_012943	CG	4	8	2055981	2055988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_012943	GACG	2	8	2056015	2056022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_012943	GGGC	2	8	2056041	2056048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_012943	GGC	2	6	2056057	2056062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_012943	CGC	2	6	2056066	2056071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_012943	CCA	2	6	2056086	2056091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_012943	ATCGG	2	10	2056115	2056124	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3628	NC_012943	CG	3	6	2056127	2056132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_012943	GCG	2	6	2056173	2056178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_012943	ACG	2	6	2056188	2056193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_012943	CGG	2	6	2056206	2056211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3633	NC_012943	AGCGC	2	10	2056281	2056290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3877	NC_012943	AGTG	2	8	2199778	2199785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3880	NC_012943	GC	3	6	2203356	2203361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3881	NC_012943	CAG	2	6	2203366	2203371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3883	NC_012943	CA	3	6	2203410	2203415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3884	NC_012943	CGA	2	6	2203466	2203471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3885	NC_012943	AGCG	2	8	2203549	2203556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3886	NC_012943	GAA	2	6	2203728	2203733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3887	NC_012943	TGG	2	6	2203750	2203755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3888	NC_012943	AC	3	6	2203784	2203789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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